Учеников могут оставить после уроков. В прошлом, если верить завхозу, оставленным после уроков назначали пытки, например, зажимание больших пальцев в тиски. Нынче оставленные после уроков, должны помогать преподавателям или персоналу в скучной или опасной работе.
Профессора могут снимать баллы или оставлять после уроков как за дисциплинарные нарушения, так и за плохие результаты в учёбе. Вне класса поддерживать дисциплину помогают старосты. В случае каких-либо споров окончательное решение принимает декан факультета.
Серьёзные дисциплинарные нарушения могут караться отчислением из школы. Единственным известным случаем исключения из Хогвартса было исключение Хагрида за владение акромантулом и за обвинения в убийстве Плаксы Миртл
Известно, что студента могут выгнать за плохую учёбу. Наказание подразумевает, что студент слишком глуп или слишком слаб в магии, чтобы стать волшебником или волшебницей. Они уезжают из школы, и у них переламывают палочку, запрещая колдовать